Вільнянське управління зрошувальних систем було створене 1 листопада 1968 року згідно наказу Міністерства меліорації та водного господарства УРСР від 1 серпня 1968 року за № 426.
З 1 січня 2005 року згідно наказу Держводгоспу України від 10.12.2004 р. № 315 Вільнянське управління зрошувальних систем перейменовано на Вільнянське міжрайонне управління водного господарства.
Основними завданнями управління є:
- участь у реалізації державної політики щодо гідротехнічної меліорації земель та експлуатації державних водогосподарських об’єктів комплексного призначення, міжгосподарських меліоративних систем;
- організація експлуатації гідротехнічних споруд і меліоративних систем, виконання поточних і капітальних ремонтів меліоративних систем і водогосподарських об’єктів комплексного призначення, що є об’єктами державної власності, а також ліквідація наслідків аварій на цих спорудах;
- організація виконання заходів загальнодержавних і регіональних програм щодо розвитку гідротехнічної меліорації земель і поліпшення екологічного стану меліорованих угідь, експлуатації державних водогосподарських об’єктів комплексного призначення, міжгосподарських меліоративних систем;
- проведення на регіональному рівні оцінки, прогнозу щодо поліпшення меліоративного стану осушувальних, зрошуваних і прилеглих до них земель, розвитку гідротехнічної меліорації земель і надання з цих питань рекомендацій.
До складу управління входять 5 експлуатаційних дільниць: ЕД-1 (с. Люцерна), ЕД-2 (с. Петро-Михайлівка), ЕД-3 (с. Новоолександрівка), ЕД-4 (с. Мар’ївка), ЕД-5 (пгт. Степногірськ).
Зрошувані землі розташовані на 9 державних системах: Вільнянській, Жовтневій, Запорізькій, Верхньо -Тарасівській, Шевченківській, Розумовській, Козачій, Першотравневій та Василівській.
До складу міжгосподарської зрошувальної мережі на теперішній час входить 41 державна насосна станція, 31,8 км магістральних каналів та 125,1 км трубопроводів.
По Вільнянському міжрайонному управлінню водного господарства площа зрошуваних земель становить 39,9 тис. га.